LP2 Biotechnologies pour la santé, l'alimentaire et l'environnement (BSAE)

Chimie organique 

Connaissance des différentes fonctions que l'on rencontre en chimie organique et en biochimie, notion de valence. 

Hybridation des atomes. 

Stéréochimie et représentation des molécules dans l'espace [configuration carbone asymétrique, chiralité] appliquées aux molécules biologiques. 

Chimie générale : 

Connaissances de la matière (atomes, molécules, ions) et des états de la matière (solide, liquide, gaz) ; préparation de solutions (concentration, dilution), notion de pH.

Biochimie : connaissances des acides aminés.

Chimie organique : 

L’enseignement de chimie organique aborde les fondements de la réactivité chimique en présentant la configuration électronique des atomes, la polarité des liaisons, les effets inductif et mésomère, les intermédiaires réactionnels, les espèces nucléophiles et électrophiles. Les réactions et les mécanismes associés à diverses fonctions chimiques, seront abordée et mises en lien avec certaines réactions biochimiques. Enfin, cet enseignement traitera des principes de la synthèse chimique des peptides et des oligonucléotides. 

Chimie générale : 

Le cours de chimie générale s’articule en trois grandes parties. La première, consacrée aux états de la matière, les états de référence et les changements d’état. Elle explore également les propriétés des gaz, elle décrit la loi des gaz parfaits et les pressions partielles. Les propriétés des solutions liquides seront décrites, en mettant l’accent sur leur composition (dilution, dissolution) et les propriétés colligatives telles que la pression osmotique. Enfin, elle traite des transformations chimiques, en introduisant la stœchiométrie, les réactions totales, l’avancement, les équilibres chimiques et la loi d’action des masses. 

La deuxième partie est dédiée à la chimie des solutions aqueuses. Elle commence par une présentation de l’eau en tant que solvant, des réactions de dissolution et de précipitation, en lien avec la solubilité et le produit de solubilité. Elle approfondit ensuite les réactions acido-basiques, les constantes d’acidité, le calcul du pH et le rôle des solutions tampons. Enfin, elle traite des réactions d’oxydo-réduction, en introduisant les états d’oxydation, les couples redox et l’équation de Nernst. 

La troisième partie propose une introduction à la thermodynamique chimique. Elle définit les systèmes et les types de transformations thermodynamiques, puis présente le premier principe, relatif à la conservation de l’énergie, en abordant l’énergie interne, le travail, la chaleur et la calorimétrie. Les deuxième et troisième principes sont ensuite étudiés à travers les notions d’entropie et d’enthalpie libre. Cette partie se conclut par des applications aux réactions chimiques, avec l’analyse des grandeurs de réaction, des critères d’équilibre chimique et des réactions standards de formation. 

Biochimie des protéines : 

Le cours de biochimie présentera les différents niveaux de structure des protéines — primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire — ainsi qu’un aperçu des principales modifications post-traductionnelles des protéines. Il introduit également les divers systèmes d’expression des protéines, qu’ils soient cellulaires (bactéries, levures, cellules eucaryotes ou d’insectes) ou acellulaires, en mettant en lumière leurs applications respectives. Enfin, une attention particulière est portée aux protéines membranaires, avec un rappel sur la structure des membranes biologiques et les spécificités techniques liées à leur extraction (notamment l’usage de détergents), leur purification et leur manipulation in vitro.

Chimie organique : 

À l’issue de l’enseignement de chimie organique, l’étudiant sera capable de reconnaitre les principales fonctions chimiques, de prévoir leur réactivité, et de relier les réactions chimiques et transformations biologiques. 

Chimie générale : 

À l’issue de l’enseignement de chimie générale, l’étudiant sera capable de maîtriser les notions fondamentales liées aux états de la matière, à la composition et à la préparation des solutions et notamment des solutions tampon, aux équilibres chimiques et aux réactions, notamment acido-basiques et d’oxydo-réduction, ainsi que d’appliquer les principes de la thermodynamique chimique. 

Biochimie :  

À l’issue du cours de biochimie, l’étudiant sera capable de décrire (i) les différents niveaux de structure des protéines (primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire), (ii) les principaux systèmes d’expression des protéines, (iii) les méthodes d’extraction spécifiques aux protéines membranaires.

Les enseignements sont dispensés sous forme de cours et de TD illustrant les notions vues en cours.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) : 

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental : connaître la nature, la structure, la fonction des macromolécules biologiques, les processus cellulaires et leur dynamique, maitriser les notions de chimie en appui des connaissances biologiques 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral, utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté  
• Accomplir son travail individuellement : organiser son travail

Les cours de Paul Arnaud - Cours de Chimie organique, Edition Dunod

Métabolisme :  

Programme et contenu des cours magistraux (CM) : 

- Le métabolisme des nitrates : vue d'ensemble du cycle des nitrates (biotechnologies vertes) 

- Anabolisme lipidique (les différents lipides, leurs structures/fonction et l'exemple d'une voie de biosynthèse) 

- Métabolisme central (Glycolyse et Cycle de Krebs, notion d'énergie et de pouvoir réducteur) 

- Respirations/Fermentations (vue d'ensemble des différents métabolismes respiratoires et fermentaires) 

Programme et contenus des TD : 

Travail en groupe (choix libre) sur un article scientifique traduit en français (Introduction, méthodes et résultats, 5 à 6 articles au choix) : isolement de la problématique scientifique (apport de connaissances en s'appuyant sur les CM dispensés), sélection des figures de résultats à présenter pour répondre à la problématique scientifique posée, élaboration d'un diaporama pour une présentation à un public n'ayant pas de connaissances préalables spécifiques à l'étude. 

Biologie cellulaire :  

Biologie cellulaire :  

- Rappels sur l'organisation de la cellule eucaryote (organites, génome, transcription, traduction) 

- Adressage et modification post-traductionnelles des protéines 

- Présentation des méthodes d'analyse du contenu protéique cellulaire (Western blot, cyrtométrie en flux, microscopie)  

- Introduction aux méthodes de recherche de partenaires protéiques (double hybride, co-immunoprécipitation).  

 Immunologie : 

- Rappels sur les bases d'immunologie (définition de l'immunité, notion de soi/non-soi) 

- Immunologie appliquée (utilisation des anticorps comme outils en biotechnologie) 

Travaux pratiques :  

 Les étudiants apprendront à manipuler les cellules végétales et animales de façon à pouvoir séparer ou visualiser les différents compartiments et structures cellulaires. Les étudiants utiliseront eux approches principales : le fractionnement cellulaire couplé à un immunoblot afin de révéler la présence de protéines spécifiques aux différents compartiments cellulaires ; la deuxième approche consistera à rendre différents organites/structures cellulaires fluorescentes pour pouvoir les visualiser à l’aide d’un microscope à épifluorescence. Pour cela, les étudiants et étudiantes utiliserons trois techniques : 1-marquage avec des molécules fluorescentes, 2-immunomarquage avec des anticorps conjugués à des molécules fluorescentes, et 3-l’expression dans les cellules des protéines fusionnées à une GFP (green fluorescence protein). Enfin, les étudiants seront initiés à l’utilisation d’un microscope à épifluorescence ainsi qu’à l’acquisition et au traitement d’images obtenues pour les échantillons. 

Diversité des organismes modèles 

- Définition d’un organisme modèle   

- Diversité des organismes modèles et pourquoi sont-ils utilisés.    

-  Les animaux de laboratoire et l'intérêt de les utiliser  

  - Connaissance des règles d’éthique associée à l’expérimentation animale  

 - Méthodes de préparation de coupes de tissus et les colorations spécifiques utilisées en histologie  

Microbiologie 2 

· _Microorganismes et environnemen_t 

- diversité des habitats (Bactéries ; Archées ; Microorganismes eucaryotes ; Notion de biofilm) 

.- Microbiote animal (dont humain) et végétal  

.- Commensale vs pathogène 

.- Résistance aux antibiotiques (réservoir) -Transfert de l’information génétique -Pili, plasmides 

e.- Différentes stratégies de lutte contre les microorganismes 

Microbiologie et ses applications 

Bioremédiation 

- identifier et caractériser la diversité des habitats où les microorganismes peuvent se développer. 

- Comprendre le concept de "limite de la vie". 

- Définir les types d’interactions entre microorganismes (symbiose, compétition, etc.). 

- Expliquer les notions de biofilms et de microbiotes. 

- Comprendre l’importance écologique et fonctionnelle des communautés microbiennes. 

- Décrire les mécanismes d’apparition des résistances aux antibiotiques. 

- Identifier et comparer les différentes stratégies de lutte contre les microorganismes. 

- Définir les deux types d’immunité procaryote  

- Illustrer leur rôle dans la défense contre les agents pathogènes.  

- Rechercher, analyser et synthétiser des sources scientifiques pertinentes.

Biologie cellulaire /immunologie

- Connaitre l’organisation générale d’une cellule eucaryote 

- Savoir décrire le principe de la transcription et de la traduction 

- Savoir décrire les modifications post-traductionnelles des protéines et leur adressage. 

- Connaitre différentes techniques de marquage cellulaire 

- Connaitre les méthodes d’identification de partenaires protéiques 

- Savoir décrire l’organisation générale du système immunitaire chez les mammifères 

TP

- Savoir identifier les différents compartiments de la cellule végétale et animale à l'aide de techniques de marquage cellulaire (marquage direct, immunofluorescence, expression des protéines fluorescentes) 

- Savoir préparer et transfecter des protoplastes de cellules végétales 

- Connaitre les conditions de culture des lignées cellulaires animales 

- Connaitre le principe de fonctionnement et savoir utiliser un microscope simple à épifluorescence 

- Savoir utiliser le fractionnement pour séparer les compartiments cellulaires 

- Connaitre le principe subjacent et savoir effectuer un immunoblot 

- Savoir manipuler avec soin et rigueur 

- Savoir consigner les manipulations dans un cahier de laboratoire 

- Connaitre les règles d'hygiène et sécurité au laboratoire 

Diversité des organismes modèles

- Définir un organisme modèle 

- Connaitre la diversité des organismes modèles et pourquoi sont-ils utilisés.   

- Connaitre les animaux de laboratoire et l'intérêt de les utiliser   

- Connaitre les règles d’éthique associée à l’expérimentation animale 

- Connaitre les méthodes de préparation de coupes de tissus et les colorations spécifiques utilisées en histologie  

Métabolisme

- Comprendre les grands principes d’une voie métabolique  

- Comprendre l’interconnexion et l’interdépendance des voies cataboliques et anaboliques  

- Comprendre les notions de flux métabolique   

- Isoler une problématique scientifique liée au métabolisme des glucides, lipides, protéines sans spécificité de modèle d’organisme et apporter des éléments de réponse à la problématique identifiée

Microbiologie

-Définir les différents types d’interactions entre microorganismes et souligner l’importance de l’organisation des communautés microbiennes (expliquer les notions de biofilms et de microbiotes) 

-Décrire les mécanismes impliqués dans l’apparition des résistances aux antibiotiques et distinguer différentes stratégies de lutte contre les microorganismes 

-Définir simplement les deux grands modes « d’immunité » rencontrés chez les procaryotes

Métabolisme :  

Cours magistraux à thème (Nitrates, lipides, métabolisme central du carbone, respirations, fermentations). TD :   travail sur une publication scientifique en français, qui explore une voie modifiée pour la production d'un composé d'intérêt, avec pour finalité une présentation orale. Cette analyse suivra la démarche scientifique adoptée en méthodologie scientifique en 1ère et 2ème années. 

Biologie cellulaire :  

L'enseignement de Biologie de la cellule et des organismes est organisé sous forme de cours, TD et d'un TP de 2 semaines. 

Diversité des organismes modèles, microbiologie : enseignement en cours et TD.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) :  

Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental : Connaître la nature, la structure et la fonction des macromolécules biologiques. Connaître les principes généraux de la transmission de l’information génétique. Connaitre les processus cellulaires et leur dynamique. Maitriser les notions de chimie en appui des connaissances biologiques. 

Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental: Enoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique. 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, de façon que les travaux puissent être contrôlés et/ou reproduits, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 

Réaliser un protocole : Identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, rédiger la liste du matériel et des réactifs nécessaires, préparer les réactifs nécessaires à l’expériences à réaliser, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie 

Collecter, organiser et valider des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience. 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral, utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté  
• Accomplir son travail individuellement : organiser son travail

Métabolisme : 

- Biochimie générale, Jacques-Henry Weil, Ed. Dunod (disponible à la BU) 

- Biochimie, Lubert Stryer, Ed. Medecine Science Publications (disponible à la BU) 

- Biochimie métabolique, Sabine Meyer-Rogge, Kai Meyer- Rogge, Ed. De Boeck

Biologie Moléculaire : Structure de l’ADN (double hélice, orientation et antiparallélisme des brins, complémentarité des bases), bases de la synthèse de l’ADN. Notions sur les macromolécules (protéines et acides aminés). Principes généraux de la réplication, de la transcription et de la traduction. Bases de la LP1.

Biologie Moléculaire 

L’enseignement de biologie moléculaire approfondit les connaissances acquises en Licence Professionnelle 1 : les mécanismes de la réplication, la transcription, la traduction.  Il propose une étude détaillée de la réplication de l’ADN, en complément des acquis de niveau licence (LP1), incluant les étapes d’initiation, d’élongation (synthèse continue et discontinue, rôle de l’ADN polymérase III bactérienne et de terminaison. Les spécificités propres aux eucaryotes, telles que la compaction du génome, les chromosomes linéaires et les télomères, seront également abordées.  Les mécanismes de la transcription seront approfondis par rapport à ceux vus en LP1, avec une attention portée à l’organisation des gènes, à la régulation de leur expression (notion de promoteur et organisation en opérons), à l’expression plasmidique (promoteurs forts et faibles), et à la maturation des ARN, notamment l’épissage. Ces notions sont traitées à la fois chez les bactéries et les eucaryotes. Les étapes de la traduction seront détaillées. Enfin, une introduction aux techniques utilisant l’hybridation moléculaire sera présentée, incluant l’utilisation de sondes nucléiques, les techniques de marquage, ainsi que les méthodes de Southern et Northern blot, essentielles pour l’analyse des acides nucléiques.  

Ces acquis sont mobilisés lors d’un TP consacré à la réalisation en autonomie d’expériences permettant d’identifier des gènes impliqués dans le métabolisme respiratoire mitochondrial chez la levure Saccharomyces cerevisiae. Les principales techniques utilisées sont : l’extraction d’ADN génomique et la purification d’ADN, l’amplification des gènes par PCR, le clonage moléculaire en utilisant un vecteur navette d’expression, et la transformation de bactéries et de levure. 

Génétique 

L’enseignement de génétique portera sur la description des mécanismes fondamentaux de la division cellulaire (mitose et méiose). 

Ce cours abordera les mutations génétiques (définitions, conséquences, lien génotype/phénotype. Il traitera également de la transmission des caractères :  ségrégation d’un et de deux couples d’allèles chez les haplobiontes et les diplobiontes (indépendants ou liés génétiquement)

A l’issue de l’enseignement de biologie moléculaire, les étudiants sauront décrire (i) la structure des gènes, (ii) les étapes clés de la réplication et les relier au cycle cellulaire, (iii) les différentes étapes de la transcription et de la traduction, (iv) la régulation de l’expression des gènes (régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle, la stabilité des ARNm et l’épissage). Enfin, ils seront en mesure d’identifier les différences majeures des mécanismes chez les bactéries et les eucaryotes. 

En TP, les étudiants mettront en oeuvre les principales techniques de biologie moléculaire telles que l’extraction d’ADN, la PCR (incluant le design d’amorces), la restriction enzymatique, le clonage et la transformation chez les bactéries et les levures. Ils acquerront la notion de crible génétique et apprendront à sélectionner les transformants de manière efficace. 

En génétique, les étudiants sauront décrire et comparer les différentes étapes de la mitose et de la méiose. Ils acquerront les notions fondamentales de la génétique mendélienne et seront capables de distinguer les notions de génotypes et de phénotypes. Ils sauront résoudre un problème de génétique, notamment en prédisant le devenir d’un ou deux couples d’allèles au cours de la reproduction sexuée, chez des organismes haplobiontes ou diplobiontes. Ils sauront identifier le nombre de sites mutés chez un mutant et ils seront en mesure d’apprécier la notion de distance génétique entre deux sites mutés (analyse de tests de ségrégation), ainsi que de calculer cette distance.

Toutes les notions de l’UE sont couvertes en CM, TD et TP pour une progression de la théorie vers la pratique. En Biologie Moléculaire, les cours magistraux (10h) présentent les mécanismes fondamentaux, ces notions sont approfondies en TD (38,5h).  

Ces acquis sont mobilisés lors d’un TP de 60h, réparti sur 3 semaines, consacré à la réalisation en autonomie d’expériences permettant d’acquérir les bonnes pratiques de laboratoire tout en menant à l’identification de gènes impliqués dans le métabolisme respiratoire mitochondrial chez la levure Saccharomyces cerevisiae. 

En Génétique, les concepts fondamentaux sont introduits lors de cours magistraux (4h) et consolidés par 16h de TD, centrés sur la résolution de nombreux exercices et la méthodologie de raisonnement en génétique formelle.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) : 

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental : connaître la nature, la structure, la fonction des macromolécules biologiques, les processus cellulaires et leur dynamique 
• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental : énoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 
• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, rédiger la liste du matériel et des réactifs nécessaires, préparer les réactifs nécessaires, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie  
• Collecter, organiser, valider et analyser des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience et analyser les résultats

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté  
• Accomplir son travail en équipe et individuellement : organiser son travail, travailler en groupe

Bases en microbiologie et biologie végétale

Microbiologie :  

CM/TD : Diversité des entités microbiologiques et virales - immunité chez les procaryotes- le potentiel biotechnologique des microorganismes et virus 

TP : Techniques expérimentales pour la culture des microorganismes et le génie fermentaire 

Identifier et caractériser la diversité des entités microbiologiques et virales  

• Principales entités étudiées en microbiologie et virologie.  

• Leur diversité phylogénétique, morphologique et structurale.  

• Comparaison des différents types de métabolismes microbiens.  

_Évaluer le potentiel biotechnologique des microorganismes et viru_s  

• Les applications industrielles de la microbiologie.  

• Illustration de l’utilisation des microorganismes et virus dans des biotechnologies.  

Maîtriser les conditions de culture et d’exploitation des microorganismes en laboratoire  

• Connaissance des règles de croissance et les paramètres de culture des microorganismes.  

• Liaison des besoins métaboliques aux conditions de culture pour optimiser la production.  

Mettre en œuvre des techniques expérimentales en microbiologie et génie fermentaire  

• Application des protocoles de culture, d’ensemencement, de fermentation et d’analyse microbiologique.  

• Utilisation des outils et équipements adaptés aux manipulations en laboratoire.  

Réaliser un travail bibliographique structuré sur l’utilisation des microorganismes en industrie  

• Rechercher, analyser et synthétiser des sources scientifiques pertinentes.  

• Concevoir un support scientifique clair et pédagogique.  

• Présenter oralement les résultats de manière argumentée et adaptée à un public scientifique. 

Biotechnologies végétales :  

Cet apprentissage actif sera organisé autour de deux séances en salle avec les enseignants tuteurs, et d'une séance en autonomie. Lors de la Séance Aller, les groupes de 4-5 étudiants formuleront le problème identifié à partir d'un document. Ils proposeront des pistes pour répondre au problème ce qui leur permettra de lister les notions à maitriser pour cette mission. Ensuite, à partir de ressources fournies par les enseignants tuteurs, les étudiants devront individuellement analyser en profondeur les documents, en se répartissant le travail au sein du groupe. Enfin, lors de la séance Retour, chaque étudiant du groupe fera une restitution aux autres membres du groupe des connaissances qu'il a acquises lors de son travail individuel. Ainsi, de manière collaborative, chaque groupe réalisera une synthèse permettant de répondre au problème identifié lors de la séance Aller. Cette séance permettra donc par une discussion de compléter voire corriger les informations ainsi restituées.

Microbiologie : Les objectifs d’apprentissage de cet enseignement visent à acquérir une vision globale et appliquée de la microbiologie et de la virologie. Il s’agit d’abord de caractériser la diversité des microorganismes et virus, tant sur le plan phylogénétique, morphologique que structural, ainsi que de comparer leurs métabolismes et de décrire les interactions microbiennes. Enfin, les étudiants devront reconnaître le potentiel industriel des microorganismes et virus à travers des applications biotechnologiques qu'ils présenteront lors d'exposés, et être capables de maîtriser les conditions de culture en laboratoire et de mettre en œuvre des techniques de microbiologie et de génie fermentaire.  

Biotechnologies végétales : 

A l’issue de l’enseignement de biotechnologies végétales les étudiants maîtriseront les notions fondamentales de biotechnologies végétales : ils comprendront le principe des différentes méthodes de transformation des plantes, auront acquis des notions de biologie moléculaire et cellulaire appliquées à la transformation génétique des cellules végétales. Ils comprendront es stratégies biotechnologiques permettant d’améliorer certains caractères d’intérêt agronomique. Ils auront à décrire et comprendre la méthodologie des différentes expérimentations visant la transformation des plantes

Microbio :  

Les notions seront abordées en CM, puis approfondies en TD. 

Enfin, un TP de génie microbiologique et fermentaire permettra de s’initier à la culture cellulaire en bioréacteur 

Biotechnologies végétales :  

L'enseignement de Biotechnologies végétales est organisé sous la forme d'un Apprentissage Par Problème (APP) intitulé "Alerte Pollution".

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) 

: 

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental : connaître la nature, la structure, la fonction des macromolécules biologiques, les processus cellulaires et leur dynamique  
• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental : énoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 
• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, rédiger la liste du matériel et des réactifs nécessaires, préparer les réactifs nécessaires, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie  
• Collecter, organiser, valider et analyser des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience et analyser les résultats 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté  
• Accomplir son travail en équipe et individuellement : organiser son travail, travailler en groupe  

Compétences en bioproduction :  

• Comprendre un procédé de production en biotechnologie 
• Mettre en œuvre un procédé de production en biotechnologie à l’échelle du laboratoire

Bases en biochimie des protéines, gestion de la qualité en biotechnologie : bases de LP1.

Bioproduction : 

Cet enseignement aborde les méthodes de purification des protéines solubles, notamment les techniques de précipitation, de chromatographie liquide (hydrophobe, échange d’ions, affinité, exclusion stérique), ainsi que les étapes de suivi et d’analyse de la protéine purifiée (dialyse, concentration, schéma de purification). L’enseignement approfondit le fonctionnement des enzymes, leurs rôles dans les procédés biotechnologiques et les différentes stratégies de catalyse enzymatique observées dans le vivant. Il inclut l’étude des enzymes Michaeliennes (réalisation et analyse de données cinétiques), ainsi que la signification des constantes cinétiques. 

Les travaux pratiques permettent de produire, extraire, purifier et caractériser une enzyme d’intérêt biotechnologique (lipase), en mobilisant des techniques de microbiologie (ensemencement, suivi de croissance), de biochimie (purification de protéines, SDS-PAGE, dosage spectrophotométrique des protéines) et d’enzymologie (mesure de l’activité enzymatique par spectrophotométrie). Des contrôles qualité sont intégrés tout au long du procédé, incluant la vérification des équipements (micropipettes), l’utilisation de procédures opérationnelles standardisées et l’analyse de la protéine purifiée par spectrométrie de masse. A cet effet, la technique de spectrométrie de masse sera présentée et appliquée à la protéine purifiée.   

Gestion de la qualité en Biotechnologie : 

L’enseignement de gestion de la qualité permet à l’étudiant de découvrir l’activité des entreprises dans différents secteurs des biotechnologies. Deux visites d'entreprise seront notamment organisées, les entreprises choisies sont spécialisées en biotechnologies (santé ou agro-alimentaire ou environnement).  Les procédés de fabrication de produits ainsi que les procédures qualité associées seront présentés par des professionnels extérieurs spécialisés en santé, en environnement, en agro-alimentaire ou en cosmétique. Une analyse de document en groupe permettra d'étudier le schéma de production d'un produit biotechnologique, de présenter les contrôles qualité qui pourraient être réalisés au cours de la production et sur le produit fini.  

Anglais : L’étudiant apprend à maîtriser un lexique scientifique et technique en anglais, nécessaire pour présenter oralement un protocole expérimental. L'enseignement vise à développer la capacité de l’étudiant à interagir avec une équipe professionnelle internationale ou anglophone, à s’y adapter et à s’y intégrer efficacement dans un contexte de travail collaboratif. Il est formé à effectuer des recherches documentaires en anglais et à comprendre l’essentiel des articles scientifiques, notamment l’état de l’art. Il s’entraîne à présenter, argumenter et défendre ses idées ou ses connaissances à l’oral en anglais. Le module intègre l’apprentissage de l’anglais technique lié au domaine scientifique, ainsi que de l’anglais général pour faciliter la communication dans un environnement international. Enfin, des structures grammaticales et phonologiques ciblées sont travaillées afin de permettre à l’étudiant de mener à bien ses projets en anglais.

Bioproduction :  

L’étudiant développe des compétences et connaissances en biochimie (purification des protéines solubles) et en enzymologie (étude de l’activité enzymatique et des paramètres cinétiques d’une enzyme) appliquées à la biotechnologie. Il apprend à mettre en œuvre les techniques de microbiologie, biochimie, enzymologie et contrôle qualité pour produire, extraire, purifier et caractériser une enzyme d’intérêt biotechnologique. 

Production et gestion de la qualité :  

L’étudiant apprend des méthodes de production et des procédures de contrôle qualité dans les secteurs biotechnologiques (santé, environnement et agroalimentaire). Ce module vise à développer une vision globale du fonctionnement d'entreprises en biotechnologie. 

Anglais :  

L’objectif est de permettre à l’étudiant de communiquer efficacement en anglais dans un contexte scientifique et professionnel, en maîtrisant le lexique scientifique et technique, les compétences orales, la compréhension d’articles scientifiques et les structures linguistiques nécessaires à la conduite de projets.

Les connaissances nécessaires à la compréhension et à la réalisation du TP de bioproduction sont enseignées avant le TP sous forme de TD, travail de groupe et cours magistraux. Des TD de préparation aux manipulations réalisées en TP sont organisés avant et pendant le TP. L'analyse des résultats est discutée en séances de TP ou lors de TD.  

L'enseignement de gestion de la qualité se basera sur des interventions de professionnels spécialisés dans le secteur des biotechnologies ainsi que sur des visites d'entreprises. Des études de cas menées en groupe par les étudiants viendront compléter ces enseignements. 

L’enseignement d’anglais est assuré par une enseignante du service de langues de l’université, différentes formes de rendus seront demandées : écrit, vidéo, oraux.

Deux visites d’entreprises en biotechnologie seront organisées et des intervenants extérieurs d’entreprises de biotechnologie participeront à cet enseignement.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) :  

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental : connaître la nature, la structure, la fonction des macromolécules biologiques, les processus cellulaires et leur dynamique, maitriser les notions de chimie en appui des connaissances biologiques 
• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental : énoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 
• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, rédiger la liste du matériel et des réactifs nécessaires, préparer les réactifs nécessaires, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie  
• Collecter, organiser, valider et analyser des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience et analyser les résultats 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Appréhender la diversité du monde professionnel : identifier les spécificités des différents secteurs d’activité (santé, pharmacie, agroalimentaire, cosmétologie…) et des différentes fonctions (R et D, production, qualité) et leurs missions associées. 
• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté  
• Accomplir son travail en équipe et individuellement : organiser son travail, travailler en groupe 

Compétences en bioproduction et gestion de la qualité : connaitre et appliquer les bases de gestion de la qualité en bioproduction 

• Comprendre un procédé de production en biotechnologie 
• Mettre en œuvre un procédé de production en biotechnologie à l’échelle du laboratoire 
• Réaliser des contrôles de matériel et une analyse biochimique du produit fini dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité 
• Utiliser des procédures opérationnelles standardisées dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité

Le projet tutoré est un travail de groupe qui s’étend sur les 3 années de la formation. 

La philosophie générale de ce projet est d’offrir aux étudiants un cadre de travail ouvert et évolutif en fonction de leurs aspirations, leurs choix et contraintes rencontrées. 

Les étudiants travailleront sur un projet innovant en biotechnologies (création d’un produit ou d’un service), de l’idée (en LP1 et LP2) à la preuve de concept en LP3.  Ce projet pourrait faire l’objet d’une valorisation (création d’entreprise). 

A l’issue de l’UE Conduite d’un projet en équipe, les étudiants auront établi un plan expérimental pour mettre en œuvre les expériences pour établir la preuve de concept. 

Impression 3D : Cours/TD : rappel des différentes étapes de conception d’un objet en impression 3D : idée, contraintes, conception à l’aide d’un logiciel CAO, fabrication et prototypage. 

Travail de groupe : choix d’un appareillage et conception intégrale de l’objet

Projet tutoré : A l’issue de l’enseignement de projet tutoré les étudiants sont capables:   

- de gérer un projet (organiser son travail, utiliser des outils de travail collaboratif, respecter des délais, travailler en équipe). 

- de mener une étude de marché, d’effectuer une veille technologique et règlementaire. 

- de mobiliser les connaissances disciplinaires et techniques nécessaires 

- de présenter clairement à l’écrit et à l’oral les étapes de réalisation de son projet en produisant des documents de différents types (fiches de suivi de projet, présentation vidéo finale) 

Projet libre impression 3D : A l’issue de l’enseignement projet libre impression 3D, les étudiants maitriseront la conception et la fabrication d’un appareillage de laboratoire simple en utilisant l’impression 3D. Ils sauront prendre en compte les contraintes de Design, utiliser un logiciel de conception, programmer l’imprimante 3D pour la fabrication de pièces et les assembler.

Projet tutoré :  

La réalisation des différentes étapes du projet est accompagnée et évaluée régulièrement au cours de séances avec l’équipe pédagogique qui se déroulent tout au long du semestre (13,5h de présentiel avec les enseignants). En dehors de ces séances, les étudiants organisent en dehors du planning fixé par la formation autant de réunions de travail que nécessaire.  

Un certain nombre de documents (descriptif du projet, rétroplanning, questionnaire de l’étude de marché) sont à rendre régulièrement selon le planning établi.  

De plus, après chaque séance avec l’équipe pédagogique et après chaque séance de travail de groupe, des fiches projet sont rédigées. Un enseignant suivra  les projets de chaque  groupe.

Impression 3D: cours et projet libre en groupe, travail en autonomie

Projet tutoré : Les étudiants seront évalués en contrôle continu par la rédaction de fiches d’avancement faisant état du projet de de sa faisabilité. L’évaluation terminale se fera sous la forme d’une vidéo présentant un pitch du projet.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d’une démarche scientifique en Biotechnologies pour la recherche, le développement ou la bioproduction : exploiter les organismes vivants ou leurs constituants, maîtriser l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental. Concevoir le plan de fabrication d’un instrument de laboratoire en impression 3D. 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser le résultat 

• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, avec rigueur

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel :  

• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’oral : présenter clairement des résultats à l’oral, utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté,  
• Accomplir son travail en équipe et en autonomie : organiser son travail, travailler en groupe

Dans le cadre de l’apprentissage, la Licence Professionnelle est conventionnée avec le Centre de Formation des Apprentis Paris-Saclay. Les contrats d’apprentissage se déroulent dans des secteurs d'activité variés (agroalimentaire, santé, pharmacie, cosmétique, environnement, instrumentation, réactifs, ...) et concernent des fonctions variées (recherche, recherche et développement, qualité, production). Ce contrat peut se dérouler dans des entreprises du secteur privé ou dans des organismes de recherche publics. Au cours de son apprentissage, l’étudiant apprend le métier de technicien supérieur dans l’un des secteurs d’activité et l’une des fonctions citées ci-dessus. L’apprenti rédige la partie introduction de son rapport.

Cette unité d’enseignement a pour objectif de permettre à l’étudiant de se professionnaliser tout en préparant l’obtention du diplôme de Licence Professionnelle en Biotechnologies. Elle vise à développer des compétences techniques et transversales en adéquation avec les exigences du métier ciblé. Elle permet à l’étudiant de découvrir le monde professionnel, de mettre en œuvre les savoirs acquis, et de renforcer les savoir-faire et les savoir-être indispensables au futur métier. A l’issue de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable de s’insérer dans la structure d’accueil et de s’approprier son projet.

Cette UE comprend deux périodes en entreprise (la première période de 2 semaines et la seconde de 10 semaines). L'apprenti est suivi par un maître d'apprentissage responsable de sa formation en entreprise et par un tuteur universitaire, enseignant de la formation, qui s’assure du bon déroulement de l’apprentissage par une visite sur site a minima et des contacts avec l’apprenti et son maître d’apprentissage. Un carnet de liaison personnel, hébergé sur un site dédié, est renseigné après la visite. Une grille d’évaluation des compétences est remplie par le maître d’apprentissage pour évaluer l'activité de l'apprenti en entreprise.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) :  

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental  
• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental : énoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique, utiliser les outils bio-informatiques élémentaires (si approprié) 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 
• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, préparer les réactifs nécessaires, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie  
• Collecter, organiser, valider et analyser des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience et analyser les résultats 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Appréhender la diversité du monde professionnel : identifier les spécificités du secteur d’activité concerné (santé, pharmacie, agroalimentaire, cosmétologie…) et de la fonction adaptée (R et D, production, qualité)  
• Se situer au sein de l’établissement d’accueil : expliquer l’activité de sa structure d’accueil et identifier ses différents services, définir son rôle et sa mission au sein de l’établissement d’accueil 
• Prendre la mesure des devoirs et des droits des salariés : connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité, les principes d’éthique, de déontologie et de responsabilité environnementale 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté, produire des documents sans faute 
• Accomplir son travail en équipe et individuellement : organiser son travail, travailler en groupe 

Compétences en bioproduction et gestion de la qualité : connaitre et appliquer les bases de gestion de la qualité en bioproduction (si adapté au poste) 

• Comprendre un procédé de production en biotechnologie  
• Mettre en œuvre un procédé de production en biotechnologie à l’échelle du laboratoire 
• Réaliser des contrôles de matériel et des analyses dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité 
• Utiliser des procédures opérationnelles standardisées dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité 
• Connaitre et appliquer les normes en lien avec le projet

Dans le cadre de l’apprentissage, la Licence Professionnelle est conventionnée avec le Centre de Formation des Apprentis Paris-Saclay. Les contrats d’apprentissage se déroulent dans des secteurs d'activité variés (agroalimentaire, santé, pharmacie, cosmétique, environnement, instrumentation, réactifs) et concernent des fonctions variées (recherche, recherche et développement, qualité, production). Ce contrat peut se dérouler dans des entreprises du secteur privé ou dans des organismes de recherche publics. Au cours de son apprentissage, l’étudiant apprend le métier de technicien supérieur dans l’un des secteurs d’activité et l’une des fonctions citées ci-dessus. L’apprenti rédige un rapport sur une expérience réalisée. Cette expérience ainsi que le bilan de compétences acquises seront présentés et évalués lors de la soutenance orale.

Dans la continuité de l’UE8, cette unité d’enseignement a pour objectif de permettre à l’étudiant de se professionnaliser tout en préparant l’obtention du diplôme de Licence Professionnelle en Biotechnologies. Elle vise à développer des compétences techniques et transversales en adéquation avec les exigences du métier ciblé. Elle permet à l’étudiant de découvrir le monde professionnel, de mettre en œuvre les savoirs acquis, et de renforcer les savoir-faire et les savoir-être indispensables au futur métier. A l’issue de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable d’être autonome pour les missions confiées en LP2.

Cette UE comprend trois périodes en entreprise/laboratoire (respectivement de 4, 7 et 11 semaines). L'apprenti est suivi par un maître d'apprentissage responsable de sa formation en entreprise et par un tuteur universitaire, enseignant de la formation, qui s’assure du bon déroulement de l’apprentissage par une visite sur site, des contacts avec l’apprenti et son maître d’apprentissage. Au cours de cette visite, l’apprenti sera évalué par son tuteur lors d’une présentation orale. Un carnet de liaison personnel, hébergé sur un site dédié, est renseigné après la visite. Une grille d’évaluation des compétences est remplie par le maître d’apprentissage pour évaluer l'activité de l'apprenti en entreprise.

La soutenance orale aura lieu le site de la formation en entreprise/laboratoire lors de la 2ème visite.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies (pour la recherche et développement ou la bioproduction) :  

• Exploiter la connaissance des organismes modèles et des macromolécules pour construire un protocole expérimental  
• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental : énoncer l’objectif et le principe des techniques expérimentales en se basant sur les connaissances biologiques, appliquer la démarche expérimentale en incluant le choix des témoins adaptés, maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique, utiliser les outils bio-informatiques élémentaires (si approprié) 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Appliquer les bonnes pratiques de laboratoire : mettre en œuvre les règles d’hygiène et de sécurité, assurer la traçabilité des données en tenant un cahier de laboratoire, choisir et utiliser les instruments de laboratoire conformément aux prescriptions d’usage, maitriser le vocabulaire technique en anglais et en français 
• Réaliser un protocole : identifier et utiliser le matériel adapté à l’expérience proposée, préparer les réactifs nécessaires, effectuer des mesures techniquement rigoureuses, fiables et répétables, réaliser une expérience, avec rigueur, en appliquant une méthode définie  
• Collecter, organiser, valider et analyser des données expérimentales : consigner avec rigueur les résultats bruts sous une forme exploitable, représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées), valider les témoins de l’expérience et analyser les résultats 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Appréhender la diversité du monde professionnel : identifier les spécificités du secteur d’activité concerné (santé, pharmacie, agroalimentaire, cosmétologie…) et de la fonction adaptée (R et D, production, qualité)  
• Se situer au sein de l’établissement d’accueil : expliquer l’activité de sa structure d’accueil et identifier ses différents services, définir son rôle et sa mission au sein de l’établissement d’accueil 
• Prendre la mesure des devoirs et des droits des salariés : connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité, les principes d’éthique, de déontologie et de responsabilité environnementale 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté, produire des documents sans faute 
• Accomplir son travail en équipe et individuellement : organiser son travail, travailler en groupe 
• S’auto-évaluer 

Compétences en bioproduction et gestion de la qualité : connaitre et appliquer les bases de gestion de la qualité en bioproduction (si adapté au poste) 

• Comprendre un procédé de production en biotechnologie  
• Mettre en œuvre un procédé de production en biotechnologie à l’échelle du laboratoire 
• Réaliser des contrôles de matériel et des analyses dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité 
• Utiliser des procédures opérationnelles standardisées dans le cadre d’une démarche d’assurance qualité 
• Connaitre et appliquer les normes en lien avec le projet

Au cours de cet enseignement, l’étudiant apprendra à utiliser un logiciel bibliographique pour organiser et gérer ses références scientifiques.  

Il acquerra des connaissances en hygiène et sécurité, telles que l’utilisation de la radioactivité en laboratoire et les risques associés, les dangers liés aux lasers, à la radioactivité et aux gaz et les moyens de protection adaptés ainsi que la réglementation en vigueur pour les laboratoires de niveaux L2 et L3. 

En biostatistiques, l'enseignement est consacré à l’apprentissage de la représentation graphique de données, du calcul de statistiques descriptives et de la mise en œuvre de tests statistiques adaptés. 

En méthodologie, l'enseignement forme à la sélection d’informations pertinentes, à l’identification d’une problématique de stage, à la présentation et description de résultats scientifiques (oral et PowerPoint), ainsi qu’à la rédaction et l’organisation de fiches techniques. 

L'enseignement de soft-skills permettra également à l’étudiant de développer son estime de soi via la narration personnelle, de comprendre les mécanismes neuropsychologiques de l’estime de soi, découvrir et la mobiliser ses forces cachées, cultiver une mentalité positive, de renforcer la confiance en soi. 

Enfin, une dimension professionnelle est intégrée avec la mise à jour du CV et de la lettre de candidature, afin de préparer efficacement l’insertion dans le monde du travail. 

Le module de développement soutenable propose une introduction aux grands défis environnementaux et sociétaux contemporains, en lien avec la transition écologique. Il vise à fournir aux apprenants une compréhension globale et critique des transformations nécessaires pour faire face aux limites planétaires et construire un avenir durable. L’enseignement portera sur le changement climatique, la biodiversité et sa préservation, les ressources et leur disponibilité, la transition juste et équitable et une réflexion sur les changements transformateurs.

Les objectifs de cet enseignement visent à permettre à l’étudiant d’acquérir des compétences scientifiques, méthodologiques et professionnelles en biotechnologie, incluant l’utilisation d’outils bibliographiques, la connaissance des règles d’hygiène et de sécurité, l’analyse statistique de données, la communication scientifique et le développement de soft-skills (orientées sur l’estime de soi) et la préparation à l’insertion professionnelle. À l’issue de ce cours, l’apprenant sera capable d’identifier, comprendre et analyser les principaux enjeux environnementaux et sociétaux contemporains, ainsi que les principes fondamentaux de la transition écologique, afin de développer une réflexion critique sur les défis actuels et les leviers d’action individuels et collectifs

Selon l'enseignement dispensé l'UE est organisée en cours et travaux dirigés d'application ou travail de groupe. Pour l’enseignement de soft-skills, il y aura une alternance de théorie, de démonstration par l’exemple et de mise en pratique grâce à de nombreux exercices individuels ou collectifs. La plupart de ces enseignements sont dispensés par des professionnels extérieurs.

Une majorité de l'enseignement est assurée par des professionnels extérieurs spécialisés dans les disciplines enseignées. Le module de développement soutenable sera réalisé en autonomie sur la base sur de supports pédagogiques divers.

Compétence 1 : Construire une démarche expérimentale dans le cadre d'une démarche scientifique en biotechnologies : 

• Appréhender l’objectif et le principe des techniques de laboratoire pour construire un protocole expérimental :  maîtriser le vocabulaire technique en anglais et en français, connaître les règles d’éthique scientifiques et les risques biologiques, physiques et chimiques, exploiter une ressource bibliographique, utiliser les outils bio-informatiques élémentaires 

Compétence 2 : Réaliser le protocole expérimental établi et analyser les résultats 

• Valider et analyser des données expérimentales : représenter les résultats expérimentaux sous la forme la plus appropriée (tableaux, courbes, histogrammes, figures légendées) 
• Analyser des résultats expérimentaux grâce aux méthodes statistiques élémentaires 

Compétence 3 : Agir dans un environnement professionnel 

• Appréhender la diversité du monde professionnel : identifier les spécificités des différents secteurs d’activité (santé, pharmacie, agroalimentaire, cosmétologie…) et des différentes fonctions (R et D, production, qualité) et leurs missions associées. 
• Connaître et respecter l’organisation de la structure d’accueil, le règlement intérieur, les règles d’hygiène et sécurité 
• Se comporter en professionnel (respect des horaires, présentation, attitude, langage) 
• Communiquer de façon adaptée à l’écrit et à l’oral : présenter clairement des résultats (cahier de laboratoire, rapports écrits et oraux), utiliser un langage scientifique rigoureux et adapté, se présenter (CV, lettre de motivation), produire des documents sans faute (syntaxe, grammaire, orthographe) 
• Accomplir son travail en équipe et en autonomie : organiser son travail, travailler en groupe 

Compétences transversales scientifiques et citoyennes : comprendre, analyser, agir et développer une conscience critique et éthique face aux défis contemporains de la transition énergétique et du développement soutenable  

Compétence transversale : développer l’estime de soi, exprimer ses pensées, ses sentiments et ses besoins de manière claire et assertive