L1 Biologie Chimie Sciences de la Terre

A l’issue de cet enseignement, l’étudiant sera capable de :

1- Percevoir le fonctionnement mental lors de l’apprentissage et développer/perfectionner des méthodes permettant de réussir ses apprentissages

• définir la notion d’évocation et de palette évocative
• distinguer les différents types de mémoire (à court et long terme, visuelle/auditive /kinesthésique/sinesthésique) et se familiariser avec des techniques de mémorisation
• identifier son propre fonctionnement mental (type d’évocation, mémoires dominante/secondaires…), pour l’exploiter dans la prise de note et l’apprentissage d’un cours

2- Développer une méthodologie scientifique

• Représenter avec pertinence des données (quantitatives) expérimentales (tableaux, graphes…)
• Générer une figure multi-panneaux à partir de différents éléments et construire une légende détaillée
• Analyser (décrire et interpréter) des données scientifiques avec un esprit critique

3- Comprendre un message scientifique sous toutes ses formes

• Repérer la structure et les informations essentielles d’un texte, les hiérarchiser en identifiant les liens logiques, les relier
• Formuler la problématique d’un article scientifique en anglais et identifier les résultats principaux
• Comprendre une question d’examen

4- Communiquer de manière correcte dans un contexte scientifique

• Exprimer une idée : se faire comprendre, convaincre, à l’écrit (rédaction de compte-rendu, répondre à une question d’examen), à l’oral (présentation en équipe d’un article scientifique)
• Construire un diaporama ou un poster illustrant son discours oral pour présenter un article scientifique
• Travailler en équipe

L'objectif est d'aider les étudiants à devenir autonomes et efficaces à l'université et, plus tard, dans la vie professionnelle. Il s'agit d’acquérir de bonnes méthodes d’apprentissage, d'être capable d'analyser, de structurer et de hiérarchiser les données et les informations disponibles, mais aussi d'améliorer leurs capacités d'exploitation et de retransmission de ces données, que ce soit oralement ou par écrit. Cette UE est également l’occasion de découvrir différentes facettes du métier de chercheur.

Pas de pré-requis

Semestre 2

L’UE est organisée en 11 séances de TD de 2 h et 1 séance de TD de 3h (1 séance par semaine). L’ensemble de l’enseignement d’un groupe de TD sera assuré par un même enseignant. L’enseignement est interactif et nécessite donc une participation active des étudiant-e-s au cours des séances. Des activités collaboratives seront régulièrement proposées lors et entre les séances.

OAV-1 Nommer et restituer les définitions précises de certaines grandes fonctions du vivant chez les animaux et les végétaux.

OAV-2 Enumérer et restituer une définition des différentes catégories de tissus animaux et végétaux

OAV-3 Savoir utiliser un microscope pour observer et analyser des échantillons biologiques (coupes d’organes) après coloration et savoir rédiger un compte rendu scientifique des observations réalisées.

OAV-4 Analyser et comparer l’organisation histologique de tissus provenant soit d’animaux soit de végétaux.

OAV-5 : être capable d’expliquer qu’il existe une corrélation constante entre la structure et la fonction à tous les niveaux de l’organisation biologique et d’utiliser ce concept pour analyser une fonction physiologique à travers l’étude de l’organisation structurelle d’un organisme animal ou végétal de la cellule à l’organe.

Dans cette UE, nous présenterons la diversité des organes et des tissus qui les composent permettant la réalisation de certaines grandes fonctions chez les animaux et les végétaux. Nous décrirons l'organisation et le fonctionnement, de la cellule à l’organe, de certains appareils. Les notions fondamentales d’identification, de définition et de reconnaissance des tissus animaux et végétaux seront abordées, en se basant sur une approche pratique et concrète d’observations au microscope. La fonction de respiration sera particulièrement illustrée chez les animaux, avec une approche comparative permettant de montrer la diversité des structures pour la réalisation d’une même fonction. Chez les végétaux, les structures de la racine, de la tige et de la feuille sont abordées chez les deux classes existantes des plantes à fleurs. Les fonctions de nutrition azotée et de circulation sont tout particulièrement illustrées, avec différents exemples permettant de montrer la diversité des structures permettant d’assurer une même fonction.

Ces enseignements de biologie végétale et animale, comprendront une grande partie de travaux pratiques (6 séances) précédés par des séances de travaux dirigés permettant d’introduire les séances pratiques.

Programme de Biologie Végétale :

TD 1h30 – TD Exploration et définition des tissus constitutifs des plantes

TP 3h00 – TP structures permettant la circulation des sèves : des racines aux feuilles Etude comparée de la structure de la racine et de la tige, coupes et coloration de coupes de tige de Sureau et de racine d’Iris.

TD 1h30 – TD Transport des sèves – mécanismes biophysiques et moléculaires permettant la circulation des sèves

TP 3h00 – TP structures permettant les échanges gazeux chez les plantes : Etude de la structure de la feuille et des stomates. Observation de coupes.

TP 3h00 – TP Diversités des structures dans la nutrition azotée : endosymbiose légumineuses/rhizobium, plantes carnivores, plantes parasites. Observation de nodosités de Soja suivi de coupe et de coloration, observation des glandes digestives de Pinguicula, observation des structures permettant le parasitisme par le Gui.

Programme de Biologie Animale :

TP 3h – Morphologie et Anatomie d’un Insecte : le criquet. Le but de ce TP est d’étudier le plan d’organisation d’un Arthropode, en insistant particulièrement sur la structure de l’appareil respiratoire chez un Insecte : le criquet. Ce TP permettra également d’aborder la structure des appareils digestif, excréteur, génital ainsi que celle du système nerveux.

TD 1h00 – Rappel et définition des tissus constitutifs des animaux en lien avec la fonction de respiration et de circulation.

TD 1h30 – La fonction de respiration chez les organismes respirant en milieu aérien et en milieu aquatique.

TP 3h– Respiration en milieu aérien. Le but de ce TP est de réaliser une étude comparative de l’appareil respiratoire chez différents organismes respirant en milieu aérien : la souris et l’araignée. Les caractéristiques fondamentales de la fonction de respiration seront illustrées, en relation avec la structure des différents types d’appareils respiratoires, et les points communs entre ces appareils seront mis en évidence.

TP 3h – Respiration en milieu aquatique. L’objectif de ce TP est de réaliser une étude comparative de l’appareil respiratoire chez deux organismes respirant en milieu aquatique : le médaka et la moule. Les caractéristiques fondamentales de la fonction de respiration seront illustrées, en relation avec la structure des appareils respiratoires.

TD 1h30– Synthèse – Circulation des gaz respiratoires.

Campbell N, Reece J, Cain M, Jackson R, Minorsky P, Urry L, Wasserman S. Biologie, 9e edition. Pearson, 2012 Speranza A, Calzoni GL. Atlas de la structure des plantes. Belin, 2004 Boutin V, Fogelgesang JF, Beaux JF, Ribola F. Atlas de biologie végétale. Dunod, 2010

Pour aller plus loin : Wheater P R, Young B, Heath J W. Histologie fonctionnelle. De Boeck, 2004 Gilles R, Anctil M, Plumier J-C, Baguet F, Charmantier G, Pecqueux A, Sebert P. Physiologie animale. De Boeck, 2006 Raven PH, Evert RF, Eichhorn SE. Biologie végétale. De boeck, 2007. Ducreux G. Introduction à la botanique. Belin, 2002.

Dans cette UE, nous présenterons la diversité des organes et des tissus qui les composent permettant la réalisation de certaines grandes fonctions chez les animaux et les végétaux. Ces enseignements seront composés des séances de travaux dirigés (7 heures) permettant d’introduire les connaissances nécessaires à comprendre le lien entre la structure et la fonction et à préparer les séances de travaux pratiques les illustrant (18 heures). Ces nombreuses séances de travaux pratiques (6 séances) seront réalisées en binômes et donneront lieu à un compte-rendu écrit rendus en fin de séance. Sur ces 6 TP, les premiers TP de Biologie Animale ou Végétale, seront corrigés mais pas notés et tous les autres TP seront notés (2 en BA et 2 en BV). Un examen final sur table clôturera l’UE.

OAV 1 : Décrire les grands types d’organisation des systèmes nerveux et leur évolution chez les animaux.

OAV2 : Identifier et décrire certains systèmes sensoriels et leurs fonctions chez l’homme.

OAV 3 : Observer et décrire certaines structures cérébrales et le tissu nerveux.

OAV 4 : Etre capable d’identifier quelques éléments d’un processus mental.

OAV 5 : Interpréter des résultats d’observation et les communiquer sous forme d’un compte rendu scientifique.

Cet enseignement a pour objectif d’amener les étudiants à découvrir l’évolution, la structure et le rôle prépondérant du système nerveux dans la vie courante des animaux. Cet enseignement s’appuie sur un ensemble de cours, de travaux dirigés d’ouverture et une part importante de travail pratique. Il vise à faire découvrir aux étudiants l’étendue du champ des neurosciences et des divers niveaux d’analyses possibles grâce à de nombreux exemples : étude des systèmes de perception, étude des bases neurobiologiques des comportements, fonctions cognitives et pathologies, neuroscience et intelligence artificielle.

Cette UE s’organisera autour de cours magistraux sur l’évolution, la structure et le rôle du système nerveux chez les animaux. Il y aura également une exploration de l’étendue du champ des neurosciences grâce à des travaux dirigés d’ouverture et des présentations de quelques doctorants volontaires pour présenter leur sujet de thèse. Finalement, des travaux pratiques permettront d’illustrer ces connaissances.

L’objectif de cette UE est que les étudiants puissent: - reconnaître et décrire les éléments constitutifs d'un génome, en particulier les éléments transposables et les régions "non-codantes" - expliquer la thérapie génique basée sur les virus et sur le système CRISPR - questionner et prendre parti sur des questions scientifiques et/ou éthiques

Cette UE a pour but de décrire la structure des gènes et des génomes, afin de comprendre leur diversité et leur évolution, ainsi que les mécanismes moléculaires capables d’y induire de la variabilité. La structure des génomes et des gènes sera présentée, ainsi que les notions de complexité génique, de duplication de gènes et de génomes, et d'éléments mobiles. Les mécanismes d'évolution et de plasticité des génomes seront appréhendés grâce à des exemples pris dans tous les domaines du monde vivant. Enfin, les particularités du génome humain seront abordées, ainsi que la thérapie génique actuelle et future, basée sur l'utilisation des virus et du système CRISPR-Cas9. Les débats organisés entre étudiants porteront d'une part sur la nature et l'évolution des séquences dans les génomes, et d'autre part, sur la thérapie génique, ses méthodes, buts et éthique.

Description detaillée du contenu

1. Génomes ; taille, composition, évolution, corrélation taille/nb d'éléments mobiles 2. Gènes codant pour des protéines, introns, épissage, exon shuffling, familles de gènes, création de nouveaux gènes 3. Eléments mobiles et conséquences de leur présence dans les génomes : modifications structurelles et d'expression induites Illustration : "Eléments mobiles et pathogénie chez les champignons" 4. Génome humain, CNV (Variation du Nombre de Copies), génétique et histoire du peuplement humain 5. Thérapie génique: virus intégratifs et CRISPR-Cas9

L'UE comprend 6h de cours, 14h de TD dont 4h de préparation au débat, et 5h de débat entre équipes étudiantes. L'UE débute par un "quizz", corrigé et discuté en séance. Les notions essentielles de l'UE sont ensuite abordées lors de cours et de TD. Deux débats sont organisés sur les deux dernières séances, entre 2 équipes étudiantes. La partie scientifique des débats sera notée par les encadrants, mais les performances dans l'art du débat seront notées par les étudiants eux-mêmes.

Acquérir des connaissance en évolution Réaliser et interpréter une expérience d’évolution expérimentale chez la bactérie E. Coli. Acquérir de la pratique en techniques de laboratoire. Mobiliser des connaissances en biochimie, génétique et mathématiques (probabilités et statistiques). Produire et analyser des données haut-débit

L1 semestre 2

Effectif = 16 étudiants maximum.

Volume horaire = 25h (3h CM, 13h TP, 9h TD)

Les objectifs d'apprentissages sont les suivants: 1/ Mener une démarche expérimentale en éthologie sur le terrain et en laboratoire a/ Intégrer les principes de la démarche scientifique dans le cadre d’études du comportement sur le terrain et en laboratoire b/ Formuler des questions scientifiques d’étude du comportement animal en les resituant dans les concepts fondamentaux de l’éthologie c/ Réaliser des observations et collecter des données dans une situation expérimentale avec des animaux vivants sur le terrain et en laboratoire d/ Traiter et mettre en forme des données pour exploiter des résultats d’expériences en éthologie sur le terrain et en laboratoire e/ Discuter et interpréter des résultats d’expériences d’éthologie f/ Rédiger un compte-rendu de TP 2/ Travailler dans un cadre collectif a/ Collecter des données en groupe et mutualiser ces données b/ Rédiger collectivement des compte-rendu d’observations, d’expériences ou de travaux pratiques 3/ Se familiariser avec des principes et des règles éthiques et pratiques d’observation d’animaux sauvages dans leur milieu naturel et d’observation et de manipulation d’animaux vivants en laboratoire. 4/ Comprendre et définir les bases biologiques et évolutives d’exemples de comportements chez différents animaux (dont humains) a/ Comprendre et définir les principes fondamentaux de l’éthologie (4 questions de Tinbergen) b/ Restituer des connaissances sur les comportements reproducteurs, territoriaux, alimentaires chez différents groupes de vertébrés, d’insectes et de mollusques c/ Observer des animaux et des comportements sur le terrain et rendre compte de ces observations avec le vocabulaire adapté. 5/ Utiliser le vocabulaire scientifique de l’éthologie pour décrire, commenter, et interpréter des résultats expérimentaux d’études comportementales

L'UE a pour objectif d'initier les étudiants à l'éthologie en présentant l'historique, les concepts, les méthodes et la démarche expérimentale de la recherche en éthologie, à travers l’étude de la biologie du comportement de différents modèles animaux (Mammifères, Oiseaux, Insectes, Mollusques Céphalopodes…). Les étudiants s'initient également à la démarche expérimentale en éthologie par une approche concrète, pratique, et en milieu naturel. Les enseignements sont découpés de la manière suivante: CM : Introduction à l’éthologie, Vie en groupe chez l’abeille : mécanismes et fonctions, Comportement prédateur et stratégies défensives chez les Céphalopodes TD : Chants des oiseaux, Ethologie humaine, Communication chez les Mammifères TP : Observations des oiseaux et de comportements en milieu naturel, Choix et préférences alimentaire des oiseaux du campus, Comportement agressif et reproducteur chez un Insecte.

Semestre 2

Giraldeau& Dubois 2009. Le Comportement Animal. Dunod. Alcock, 2013. Animal Behavior. Sinauer Associates

Les enseignements sont sous forme de cours magistraux (7h), travaux dirigés (6.5h) et travaux pratiques (11.5h). Une partie des enseignements a lieu sur le terrain. CM : Introduction à l’éthologie, Vie en groupe chez l’abeille : mécanismes et fonctions, Comportement prédateur et stratégies défensives chez les Céphalopodes TD : Chants des oiseaux, Ethologie humaine, Communication chez les Mammifères TP : Observations des oiseaux et de comportements en milieu naturel, Choix et préférences alimentaire des oiseaux du campus, comportement agressif et reproducteur chez un Insecte.

Être capable de reconnaitre un certain nombre de plantes de la flore commune de la région. Être capable de réaliser un inventaire floristique. Être capable d’utiliser une flore et d’autres outils d’identification. Connaitre les caractéristiques des principales familles d’Angiospermes. Être capable d'associer la composition floristique d'une zone à un type d'écosystème. Pour un certain nombre de plantes, connaitre leur biologie, leurs interactions avec d’autres espèces, les paramètres de l’environnement qui expliquent leur distribution. Être capable de faire une présentation de la flore présente dans un milieu.

Cet enseignement est destiné à faire acquérir aux étudiants une connaissance concrète de la Flore de la région par l’acquisition de techniques d’identification, et d’observations concrètes sur le terrain (campus et environs). Nous apprendrons à reconnaitre les plantes communes de la région et apprendrons des éléments concernant leur biologie et leur écologie.

Avoir le goût d'observer la nature et d'être sur le terrain.

L1 Semestre 2

"Petite flore de France" de Régis Thomas, David Busti, Margarethe Maillart. Edition Belin, 2016

Le travail s'appuie sur des sorties sur le terrain, des échantillons concrets et une mise en pratique des apprentissages. L'enseignement comporte 7 séances de 3 heures et 1 séance de 4 heures. Séance 1 : Les arbres du campus Séance 2 : Les outils du botanistes Séance 3 à 5 : Les familles botaniques Séance 6 : Diversité des plantes tropicales Séance 7 : Les plantes, la nature et l'homme Séance 8 : Inventaire floristique

1. Savoir suivre un protocole expérimental et ranger son matériel à la fin

2. Savoir rédiger un compte-rendu de TP

On souhaite ici que l’étudiant soit capable de structurer un compte-rendu en respectant les sections suivantes : Titre ; Introduction ; Matériel et méthode ; Résultats ; Conclusion. L’étudiant doit savoir organiser ses idées et ses données afin qu’elles soient exposées de manière concise mais complète dans les bonnes sections.

3. Réaliser un dessin d’observation

L’étudiant doit appliquer une méthode pour réaliser son dessin en le complétant par un titre, des légendes complètes, en fournissant une échelle et en indiquant les axes de polarité.

4. Présenter un exposé devant la classe sur le thème: le développement de votre organe préféré (chez l'organisme de votre choix).

Observation et manipulation de plusieurs organismes en cours de développement au travers de séances de TP d'une demie-journée en présence d'un chercheur spécialiste du modèle. Il y aura également une demie-journée d'exposés portant sur le développement d'organes spécifiques chez d'autres modèles (ouverture).

semestre 2

Séances de TP sur 5 organismes modèles (une ou deux séances par modèle) et séances d'exposés. Evaluation en contrôle continu sur les comptes-rendus de TP notés ainsi que l'exposé.

A l’issue de cet enseignement, les étudiants sont capables :

• De définir les notions d’interactions parasitaires et symbiotiques dans le monde du vivant et plus particulièrement entre des plantes et des microorganismes (bactéries et eumycètes) et de discuter des grands enjeux de ces interactions pour la société et les agro-écosystèmes.
• Sur la base de l’observation d’échantillons végétaux parasités et des connaissances acquises, de proposer des hypothèses biologiques quant à l’origine d’une maladie et de planifier une démarche expérimentale pour confirmer une hypothèse et relier les observations microscopiques aux observations macroscopiques.
• De mettre en œuvre quelques techniques simples (microscopie, culture en conditions stériles, colorations, pesées) pour étudier les plantes et les microorganismes en interaction symbiotique et parasitaire, de l’échelle macroscopique à l’échelle microscopique.
• D’analyser, interpréter et confronter des données scientifiques, en incluant une analyse statistique simple de données chiffrées.
• De restituer les expériences et leurs résultats sous la forme d’un compte-rendu écrit et oral.

L’UE propose d’aborder les notions d’interactions biologiques entre individus d’espèces différentes au travers de l’étude du parasitisme et de la symbiose. Les cours présentent les définitions fondamentales de ces différents types d’interactions, illustrent la biodiversité des organismes interagissant (animaux, végétaux, microorganismes) et l’importance écologique et sociétale de ces interactions. L’apprentissage par travaux pratiques associé à un travail par projet permet aux étudiants d’acquérir des compétences techniques de base en microscopie et microbiologie pour l’observation, l’analyse d’échantillons parasités ou en symbiose avec des microorganismes. Le matériel végétal est plus particulièrement étudié en TD/TP car il offre une diversité importante et facilement accessible d’interactions parasitaires et symbiotiques avec des microorganismes.

- COURS 1 (3h) : Interactions des organismes avec leur environnement biotique (les différents types d’interactions, intra-, inter-spécifiques) et cas des interactions parasitaires dans le monde du vivant. Présentation des notions associées au parasitisme : différents interactants à différentes échelles, notions de maladie, symptômes, cycle parasitaire, diagnostic, méthodes de lutte, importance sociétale et écologique de ces interactions en santé humaine, animale, végétale. Parallèles entre parasitisme animal et végétal, contraintes de l’expérimentation sur les animaux.

- TD (5h) / TP (6h) : Travail par projet autour du thème ‘Analyse d'échantillons végétaux parasités’ (travail autour du postulat de Koch ; les étudiants se mettent en situation de projet pour la réalisation d’un diagnostic). Contenu :

• TD interactifs (2h) : Présentation du TP ‘Analyse d'échantillons végétaux parasités’, travail par classe inversée autour des caractéristiques macroscopiques et microscopiques à observer pour reconnaitre des bactéries et eumycètes parasites et identifier les maladies associées.
• TP (6h) : ‘Analyse d'échantillons végétaux parasités’ :

Observation des échantillons végétaux, 2) élaboration d’hypothèse(s) quant à l’origine microbienne de la maladie et proposition d’un plan expérimental pour travailler sur une hypothèse choisie, 3) prélèvements et mises en culture, 4) observation de la diversité des microorganismes en culture 5) Isolement, ré-inoculation d’un microorganisme.

• TD interactifs (3h) : Présentation orale (notée) par binôme de la démarche expérimentale et des résultats obtenus. Discussions pour l’amélioration du compte-rendu de TP (noté) à rendre ultérieurement.

- COURS 2 (3h) : Interactions symbiotiques dans le monde du vivant.

- TP (2h) : Observations de différents échantillons végétaux en symbiose avec des bactéries ou eumycètes symbiotiques (échantillons récoltés sur le campus d'Orsay).

- TP (6h) : Etude de l’effet de bactéries symbiotiques du sol sur la croissance de la luzerne. 1) Inoculation de bactéries symbiotiques sur les racines de luzerne, 2) analyse des plantes inoculées afin de mettre en évidence l’effet bénéfique des bactéries sur la croissance des plantes et 3) utilisation d’outils de statistiques simples pour l’analyse et l’interprétation des données générées (initiation aux statistiques). Un compte-rendu écrit de TP à rendre (noté).

Connaissances niveau L1 1er semestre sur la biologie des eucaryotes (animaux, eumycètes, plantes) et des procaryotes (bactéries). Connaissances basiques pour l'utilisation d'une loupe et d'un microscope optique.

Semestre 2

Quelques heures de cours sont dispensées pour donner aux étudiants les notions de base nécessaires à la compréhension des interactions parasitaires et symbiotiques et de leurs enjeux. L’UE sera séquentiellement organisée en deux parties : les interactions parasitaires puis les interactions symbiotiques. Les TP illustrent les notions vues en cours et abordent les démarches expérimentales pour étudier ces interactions. Le matériel végétal est plus particulièrement étudié en TD/TP car il offre une diversité importante et facilement accessible d’interactions parasitaires et symbiotiques avec des microorganismes. Le TP de la partie parasitisme repose sur un travail en situation de projet : les étudiants disposent d’échantillons végétaux parasités (malades) pour lesquels ils doivent mettre en œuvre une démarche expérimentale pour établir l’origine de la maladie. Cette démarche inclut la définition des questions biologiques (hypothèses de maladies/parasites), la proposition d’une démarche expérimentale et sa mise en œuvre, l'analyse des résultats obtenus, les conclusions à tirer et des propositions de méthodes de lutte. Des TD interactifs (classe inversée pour réfléchir à l’observation des microorganismes, exposés oraux de leurs démarches expérimentales et des résultats associés) sont proposés pour accompagner les étudiants dans cette démarche et dans la rédaction du compte-rendu de TP. Une initiation à l’utilisation d’outils de statistiques simples est réalisée sur les jeux de données chiffrées générés par les étudiants au cours des séances de TP symbiose. L’évaluation comporte 2 comptes rendus de TP (1 compte rendu sur chaque partie de l’UE parasitisme/symbiose) et un exposé oral (présentation des expériences du TP parasitisme).

OAV1- Expliquer les éléments théoriques de base des thèmes abordés lors des expérimentations en utilisant les termes scientifiques adéquats

OAV2- Décrire et réaliser toutes les étapes d’une expérimentation scientifique simple

OAV3- Communiquer de façon claire, concise et rigoureuse à l’écrit comme à l’oral en utilisant les termes scientifiques adéquats

OAV4- Se projeter vers une poursuite d’étude et découvrir le métier de chercheur

Cet enseignement a pour but de fournir à l’étudiant un premier contact avec les différentes facettes de la recherche. Il conviendra donc à tous les étudiants désireux de découvrir comment mener un projet de recherche, de sa conception à la valorisation des résultats obtenus. Un volet expérimental fort, basé sur une participation active de l’étudiant (travail de groupe privilégié), est complété par des visites et des discussions avec des chercheurs. Le contexte de travail choisi intègre plusieurs aspects du monde végétal et en particulier les relations entre la plante et son environnement.

Aucun pré-requis

Semestre 2

Non pertinent

Une grande place est accordée aux travaux de groupe et à l'autonomie des étudiants, l'enseignant étant souvent dans la posture d'accompagnant.

Déroulement et organisation pratique

• Présentation des objectifs de l’UE
• Introduction et quelques notions de base (2h30)
• Réflexion sur le choix des expériences à réaliser (travail de groupe, 3h)
• Mise en place des expériences (travail de groupe, 3h30)
• Réalisation des expériences (travail réparti entre les étudiants, 5h)
• Fin des expériences, prises de photos, compilation des résultats (travail de groupe, 3h)
• Travail de groupe en autonomie (facultatif)
• Présentation d’exposés sujets libres ou proposés (3h)
• Visite d’instituts de recherche (IPS2, Centre INRA Versailles) (5h)

Modalités de contrôle des connaissances: Rédaction d’un article scientifique à partir des résultats obtenus lors du projet Présentation orale d'un thème au choix (facultatif) Examen oral

• Aborder la biodiversité des eucaryotes du campus par une approche naturaliste.
• Acquérir des méthodes d’observation macroscopique et prélèvements sur le terrain.
• Rendre compte des observations microscopiques (loupes binoculaires et microscope) par la réalisation de dessins d’observation.
• Trier et ordonner la diversité observée à l’aide de clés ou critères d’identification, faunes, flores.
• Situer la diversité observée dans l’arbre phylogénétique des eucaryotes étudié au premier semestre.

L'UE BIOCAMPUS vise à explorer la biodiversité des eucaryotes sur le campus universitaire par une approche naturaliste : prélèvements sur le terrain, observations et déterminations en salle. Les groupes d'Eucaryotes abordés sont les Eumycètes (champignons dont lichens, 6h), les Métazoaires (oiseaux, faune des mousses et des mares, 6h), la Lignée Verte (mousses et plantes vasculaires, 7h) ainsi que des Protistes de diverses branches (ciliés, amibes, myxomycètes, algues vertes..., 6h). Cette UE s'adresse à des étudiants intéressés par les domaines de la Biodiversité et de l'Écologie.

Programme : - EUMYCÈTES dont LICHENS : 1h cours, 2h sortie prélèvements, 3h TP observation, analyse. - BRYOPHYTES : 1h cours, 3h sortie/TP. - TRACHÉOPHYTES : 0,5h cours, 2,5h sortie/TP. - OISEAUX : 1h cours, 2h sortie. - MYXOMYCÈTES : 0,5h cours, 2,5h TP. - FAUNE et PROTISTES des mares et des mousses : 1h cours, 5h sortie/TP.

Second semestre. De mars à mai.

Toutes les séances sont des travaux pratiques et/ou sorties sur le terrain, précédés d'un cours introductif.

OAV 1 : Découvrir ce qu’est la biologie de synthèse - Connaître les concepts d’ingénierie associés à cette discipline - Connaître les objectifs, promesses et limites de la biologie synthétique - Connaître quelques exemples de châssis classiquement utilisés en biologie synthétique - Connaître quelques exemples de biobriques - Connaître l’agencement classique de cassettes d’expression au sein de bactéries et d’eucaryotes - Savoir reconnaître et proposer des agencements de biobriques en circuits au comportement prédictible - Connaître quelques exemples de promoteurs inductibles et la notion de biosenseur - Connaître le concept d’évolution dirigée

OAV 2 : Connaître les bases du clonage et de la modification génétique des organismes à travers des enseignements théoriques et expérimentaux.

• Connaître le principe du clonage par enzymes de restriction et du clonage « AT »
• Connaître le principe de la PCR
• Connaître le principe du criblage blanc-bleu
• Savoir lire et appliquer un protocole
• Savoir réaliser des calculs dans le cadre expérimental (calcul de dilution, calcul de concentration, application de la règle de 3)
• Organiser son poste de travail
• Savoir manipuler en respectant les règles de sécurité
• Savoir réaliser avec précision des prélèvements à la pipette
• Savoir manipuler des bactéries en respectant les conditions d’asepsie et la chaîne du froid (préparation de bactéries compétentes)
• Savoir réaliser des mesures expérimentales précises
• Savoir introduire un ADN dans une bactérie (transformation par choc thermique)
• Savoir extraire l’ADN d’une bactérie (minipréparation d’ADN)
• Savoir analyser l’ADN après électrophorèse sur gel

OAV 3 : Développer des compétences en analyse bioinformatique et exploitation numérique des données

• Savoir récupérer des séquences nucléiques in silico (concept « adopte une biobrique » dans le cadre duquel l’étudiant(s) choisit la biobrique du registre de l’iGEM qu’il/elle clonera en travaux pratiques)
• Savoir manipuler in silico une séquence nucléique (traduction, insertion au sein d’un plasmide, analyse des profils de digestion par enzymes de restriction)
• Savoir rechercher des similarités de séquences (approche BLAST)
• Savoir réaliser un tableau bilan des résultats expérimentaux à l’aide d’un tableur.

OAV 4 : Savoir analyser et interpréter des résultats

• Identifier les paramètres fixés par l’expérimentateur
• Identifier les paramètres mesurés par l’expérimentateur
• Maîtriser la notion de contrôle négatif, positif et de témoin de charge
• Savoir décrire les observations de façon précise
• Savoir structurer une argumentation selon la démarche « J’observe » - « Je sais » - « Je déduis » - « J’émets une hypothèse » - « Je propose une expérience »

OAV 5 : Développer l’esprit critique lors de l’analyse des projets de biologie synthétique au regard de leur possible impact philosophie, économique, sociétal et éthique.

OAV6 : Savoir rédiger un compte rendu expérimental

OAV 7 : Communiquer à l’oral et apprendre à travailler en groupe (présentation orale d’un projet de biologie synthétique)

OAV 8 : Savoir exploiter un document rédigé en anglais (à travers l’analyse approfondie d’un projet iGEM)

Contexte : La biologie synthétique combine les savoirs en biologie, ingénierie génétique et innovations biotechnologiques dans le but de concevoir des systèmes biologiques aux propriétés nouvelles. A l’instar de la célèbre citation du physicien Richard Feynman, « Ce que je ne peux pas créer, je ne le comprends pas », ce domaine scientifique en pleine expansion élargit le champ des possibles en Biologie et apporte de nouveaux concepts dans des domaines fondamentaux (e.g. génome minimal, xénobiologie) ou appliqués (e.g. sécurité et efficacité de souches d’intérêt). La biologie synthétique pose des défis originaux et soulève aussi des questions éthiques et sociétales. Compétences : Les étudiants qui suivront ce cours approfondiront leurs connaissances en génétique et microbiologie, et développeront leur aptitude à effectuer une analyse critique de résultats scientifiques. Cette formation est axée autour de la créativité scientifique. Descriptif : Cet enseignement est constitué de cours magistraux au cours desquels sont explorées les notions de biobriques, de réseaux de régulation de l’expression génique et de modifications génétiques d’organismes d’intérêt. Des exemples sont développés dans les principaux axes de recherche de la biologie synthétique dont les biotechnologies et l’évolution dirigée. Lors des travaux dirigés, les étudiants analysent les résultats d’articles de recherche originaux dans le domaine (e.g. génome dont une base a été remplacée par un composé non naturel). Des travaux dirigés en salle d’informatique sont consacrés à la conception d’un clonage et permettent de sensibiliser les étudiants à l’utilisation de logiciels d’accès libre dédiés à l’analyse de séquences biologiques. Des travaux pratiques viennent compléter cet enseignement de façon à initier les étudiants aux techniques de biologie moléculaire (analyse d’ADN sur gel, minipréparation d’ADN, digestion enzymatique de l’ADN, transformation bactérienne). Dans le cadre d’un travail personnel, les étudiants présentent un projet de biologie synthétique, souvent choisi parmi les projets de recherche proposés lors de compétitions iGEM ( International Genetically Engineered Machine - https://igem.org/Main_Page).

Bonnes connaissances (niveau Terminale - L1S3) en génétique et biologie moléculaire Intérêt personnel pour la réflexion autour de projets scientifiques répondant à des enjeux de société et pour la créativité dans ce domaine.

Second semestre de la L1 Lieu des enseignements : Campus d'Orsay ou site du CNRS de Gif-sur-Yvette

La biologie de synthèse soulève des questions d'ordre sociétal, philosophique et éthique qui sont discutées notamment dans l'ouvrage suivant : Bernadette Bensaude-Vincent et Dorothée Benoit-Browaeys, "Fabriquer la vie. Où va la biologie de synthèse ?" Edition Seuil, 2011

Plusieurs articles rédigés en français dans un hors série du journal Médecine/Sciences [M/S 2013 ; 29 (hors série n°2)] offrent un panorama intéressant du contexte et des enjeux autour de la biologie de synthèse (voir le lien : https://www.medecinesciences.org/en/articles/medsci/abs/2013/07/content…)

Les projets de biologie synthétique développer dans le cadre de la compétition iGEM ( International Genetically Engineered Machine) sont disponibles sur le lien suivant : https://igem.org/Main_Page

Cours : 7,5 h ; TD : 11,5 h ; TP : 6 h Cours magistraux : présentations des concepts-clés de la biologie de synthèse Travaux dirigés en salle classique : analyse de résultats scientifiques Travaux dirigés en salle de bioinformatique : conception in silico du clonage réalisé en travaux pratiques Travaux pratiques : initiation à la biologie moléculaire et à la microbiologie à travers le clonage d'une biobrique que l'étudiant(e) aura choisie dans le registre de l'iGEM Modalités pédagogiques particulières : développement du concept "Adopte une biobrique" à travers lequel l'étudiant(e) choisit une biobrique dans le registre de l'iGEM, analyse sa séquence (séance de bioinformatique) puis réalise son clonage ; supports pédagogiques variés et quizz d'entraînement disponibles sur le site eCampus ; travail personnel autour d'un projet de biologie synthétique choisi et présenté à l'oral par les étudiants. Capacité d'accueil : 20 étudiants Modalités de contrôle des connaissances : Session 1 : UE1 = 0,25*O (présentation d’un projet de biologie synthétique) + 0,25*S (compte-rendu de TP) + 0,5*T2 (2 ou 3 QCM/QCRO) Session 2 : UE2 = 0.5*UE1 + 0.5 S

- Synthèse organique : apprendre à manipuler selon les bonnes pratiques de laboratoire, comprendre les réactions chimiques mises en jeu, analyser les composés synthétisés (analyses physico-chimiques). - Comprendre les processus physico-chimiques mis en jeu dans la préparation de formules cosmétiques (émulsion, interactions H/E ou E/H). - Réaliser des synthèses et/ou extraction de composés entrant dans la composition de formulation de cosmétique/parfumerie. Réaliser une formule cosmétique (lait, crème, shampooing, etc..)

Option de chimie majoritairement expérimentale, traitant principalement des composés et formules utilisés dans l’industrie cosmétique. Cet UE donnera un aperçu de la synthèse de composés chimiques présents dans la composition des formules cosmétiques telles que les crèmes, dentifrices, shampooings, parfums etc...

Chimie de tronc commun du premier semestre, "De l'atome à la matière" (BCST ou PCST). L'étudiant devra démontrer un intérêt pour les approches expérimentales en chimie.

Premier semestre calendaire (second semestre universitaire). Localisation au bâtiment 333, aile de chimie.

Cet enseignement sera essentiellement dispensé sous forme de travaux pratiques. Un cours/TD servira également de support préalable aux TP pour mettre en place certaines notions importantes utilisées lors des TP. Une recherche bibliographique pourra aussi être demandée comme support des TP.

Apprendre à manipuler de manière très rigoureuse, comprendre les phénomènes mis en jeu lors des réactions chimiques.

Option de chimie majoritairement expérimentale et traitant principalement des réactions d’oxydoréduction, de combustion, d’émission et d’absorption de lumière ainsi que des notions de complexes de coordination.

Premier semestre calendaire

3*2h de cours-TD et quatre séances de TP de 4h évalués.

• Réaliser en autonomie une démarche expérimentale
• Maîtriser l’utilisation de la verrerie de base de laboratoire
• Maîtriser les notions de base dans la chimie des solutions (préparation d’une solution, unités de concentration, réaliser une dilution, équilibrage des réactions chimiques)
• Se familiariser avec quelques techniques de base de l’analyse chimique : absorption UV/VIS, Infra rouge, absorption atomique, dosage volumétrique.
• Préparer des échantillons pour l’analyse chimique
• Etalonner un appareil de mesure
• Interpréter et exploiter des résultats expérimentaux (déterminer une concentration à partir d’un dosage, faire une droite d’étalonnage, estimer l'intertitude de mesure, identifier les groupes fonctionnels par la spectroscopie d’Infrarouge)
• Développer un esprit critique
• Rédiger d’un compte-rendu de TP

Cet enseignement est dédié à la présentation de quelques techniques courantes d’analyse chimique et leurs applications. Développé autour de la pratique expérimentale, il aborde l’utilisation des méthodes de dosages et les techniques spectroscopiques pour les analyses des produits de la vie au courant tels qu’une pièce métallique, une boisson énergétique ou un vin. Dans un premier temps, les concepts et les techniques d’analyse seront introduits lors des séances de cours. La deuxième partie sera une approche expérimentale de méthodes telles que les dosages d’oxydo-réduction, l’absorption UV-VIS, l’absorption infra-rouge (IR) et l’absorption atomique (AAS). Ces techniques seront appliquées pour analyser les produits du quotidien lors des séances de TP.

Programme physique-chimie du lycée

semestre 2

Analyse chimique – Méthodes et techniques instrumentales. Francis Rouessac, Annick Rouessac (Dunod) Analyse chimique quantitative de Vogel. Mendham, Denney, Barnes, Thomas (De Borck)

L’UE comporte 5 séances de cours de 1,5h et 5 séances de TP de 3,5h. L’évaluation est réalisée au travers des contrôles continus (QCM de cours, compte-rendus de TP, manipulation en séance) et d’une épreuve terminale.

• Décrire, observer, manipuler différents types de roches (magmatiques, métamorphiques, sédimentaires, d’altération)
• Distinguer et cataloguer différents domaines géologiques à partir de documents cartographiques
• Acquérir les bases dans les domaines de la pétrographie et la minéralogie
• Choisir des outils mathématiques et géochimiques simples afin de retrouver les caractéristiques des roches
• Reproduire une expérimentation permettant de comprendre la dynamique de croissance ou de dissolution des cristaux
• Restituer la classification des grandes familles de roches en choisissant les arguments appropriés

Le but de cette UE est de faire découvrir aux étudiants les matériaux des enveloppes terrestres par la description et l’observation macroscopiques des différentes familles de roches. L’étudiant définira également les minéraux constitutifs de ces roches. In fine, l’étudiant pourra restituer les processus de formation et de cristallisation guidant leur formation. Pour atteindre cet objectif, les étudiants examineront des cartes géologiques pour associer des types de roches aux grands domaines de la géologie de la France. L’étudiant pourra alors discuter des conditions de leur formation et leur évolution au cours du temps. In fine, les étudiants devront associer la composition minéralogique des roches aux principes de géochimie et de cristallochimie permettant de comprendre leur formation.

UE fondamentales (Système Terre, Climats, Energies) et d’option (Mesures en géosciences)

Semestre 2

• Michel Hoffert, André Schaaf, Marc Tardy, Armelle Baldeyrou Bailly, Gilles Merzeraud, André Brahic, René Maury Sous la coordination de Jean-Yves Daniel 2014. Sciences de la Terre et de l'univers. Vuibert, 3e édition, 832 p., ISBN : 978-2-311-00967-5.
• Jean-François Beaux, Jean-François Fogelgesang, Philippe Agard, Valérie Boutin. 2015. Atlas de géologie-pétrologie BCPST 1re et 2e années. Dunod, 2ème édition, 144 p., EAN13 : 9782100726547.
• Yves Lagabrielle, René Maury, Maurice Renard. 2013. Mémo visuel de géologie - L'essentiel en fiches et en couleurs. Dunod, 256 p., EAN13 : 9782100584994.
• Simien, F., 2009, La France sous nos pieds, Atlas en 50 Géocartes. BRGM, ISBN-13 : 978-2715924741.
• Sorel, D. et P. Vergely, 2018. Atlas d’intiation aux cartes et coupes géologiques, Dunod, 128 pp., EAN9782100791439

Les enseignements seront dispensés sous forme de cours magistraux et de travaux pratiques et dirigés associés. L’évaluation sera faite via une épreuve finale de synthèse mais également par un suivi régulier (modalités de contrôle des connaissances à préciser).

OAV 1 : Décrire et expliquer la notion de santé au travail OAV 2 : Analyser les liens entre les capacités humaines et le travail OAV 3 : Analyser, hiérarchiser, organiser et synthétiser des informations/données en vue de leur présentation

Cette unité d’enseignement vise à sensibiliser les étudiants à acquérir des connaissances sur le lien entre la santé et le travail. Elle apportera des connaissances théoriques sur la compréhension du lien entre le fonctionnement humain, la santé et les activités de travail. Cette option a été pensée en articulation avec l’UE Prévention des risques et Ergonomie proposée en L2 et l’UE Introduction à l’ergonomie et au métier d’ergonome proposée en L3. La finalité est d’apporter à des étudiants de biologie des connaissances qui leur permettront de comprendre comment les notions acquises en licence de biologie peuvent être mobilisées en ergonomie. Le suivi de ces enseignements leur donnera des bases théoriques et pratiques utiles pour intégrer le Master d’Ergonomie de l’Université de Paris-Saclay. A l’issue de cette unité d’enseignement, les étudiant devraient être capable de :

• Décrire et expliquer la notion de santé au travail
• Analyser les liens entre les capacités humaines et le travail
• Analyser, hiérarchiser, organiser et synthétiser des informations/données en vue de leur présentation

semestre 2

Les enseignements sont dispensés sous forme de cours magistraux et de travaux dirigés par des enseignants-chercheurs et des ergonomes. Les cours magistraux visent un apport de connaissances sur les notions de Santé et de Travail. Les séances de travaux dirigés sont consacrées à la réalisation d’un mini projet dans lequel les étudiants travailleront les liens entre les connaissances sur les capacités humaines issues de la biologie et les activités de travail. Ce mini projet se fera sur un thème donné. Un travail de mise en débat des recherches documentaires et des analyses réalisées par les étudiants se fera par groupe avant une restitution collective devant les autres groupes. Par exemple les étudiants pourront être amenés à instruire les thèmes suivants :

• Comment les connaissances scientifiques sur les systèmes sensoriels humains peuvent orienter la conception des espaces de travail ?
• Comment les pathologies chroniques sont prises en comptes dans le monde du travail ?
• Quelles sont influences des pathologies chroniques au quotidien dans les activités de travail ?

L’objectif d’apprentissage visé (OAV) terminal À l’issue de l’UE Challenge, chaque étudiant L1 BCST sera capable, au travers d’activités ludiques, de remobiliser ses connaissances en biologie et chimie du S1 et de consolider ainsi ses acquis pour réussir la L1.

OAV 1 : Remobiliser et consolider ses connaissances en biologie et chimie du S1 1. Connaître par cœur les formules, les démonstrations, les définitions, … 2. Extraire des informations essentielles d’un cours 3. Proposer des liens entre des connaissances déjà acquises et les illustrer par des exemples 4. Retrouver des informations pour résoudre un exercice et /ou répondre à une question 5. Intégrer le raisonnement et la logique pour répondre aux questions et résoudre les exercices

OAV 2 : Acquérir de nouvelles méthodes d’apprentissage en travaillant en groupe 1. Organiser le contenu d’un cours et le restituer sous forme d’un tableau, un résumé, une carte mentale, … 2. Créer des flashcards (application Quizlet) avec des questions/réponses et les utiliser pour consolider ses connaissances 3. Présenter une partie du cours sous forme d’un jeu (questions pour un champion) 4. Présenter une partie du cours sous forme d’une bande dessinée 5. S’autoévaluer et évaluer ses pairs

L’UE Challenge est une UE d’aide à la réussite en L1. Elle est destinée à des étudiants ayant rencontré des difficultés au semestre 1 et désirant remobiliser et consolider leurs connaissances au travers d’activités ludiques et un travail actif, pour réussir leur année. Le programme de l’UE Challenge est basé essentiellement sur trois UE de biologie, chimie et biologie-chimie du S1.

Remobilisation de la biologie (11h) : À part la partie introduction, toutes les autres séances comportent un travail en groupe. 1- Introduction basée sur des rappels et test de prérequis (1h30) 2- Génétique et biologie moléculaire (2h30) : extraction d’informations à partir des polys de cours et de TD 3- Évolution (1h30) : travail sur des annales 4- Diversité (2h30) : classe inversée et restitution sous forme d’un jeu (question pour un champion) 5- Diversité (1h30) : travail en autonomie pour préparer la classe inversée 6- Activité transverse entre la GBM et l’évolution (1h30) : jeu de questions/réponses avec les flashcards en utilisant l’application Quizlet

Remobilisation de la biologie-chimie (5h) : Travail en groupe 1- Rappels et tests de prérequis sous forme d’exercices (1h30) 2- Présentation d’une partie du cours/TD sous forme d’une bande dessinée (2h) 3- Travail en autonomie pour préparer la bande dessinée (1h30)

Remobilisation de la chimie (9h) : Travail en groupe 1- Test des prérequis sous forme d’exercices (1h30) 2- Configuration électronique (1h30) : classe inversée sur la partie cours et restitution sous forme de présentation orale. Exercices d'application et correction 3- Travail en autonomie pour préparer la classe inversée (1h30) 4- Structure et géométrie des molécules (1h30) : réalisation d’une fiche résumant le chapitre avec les règles à suivre dans l’établissement des structures moléculaires et travail sur des exemples 5- Molécules organiques (1h30) : jeu avec des flashcards (questions/réponses) sur la nomenclature, la géométrie et les systèmes électroniques délocalisés 6- Cohésion de la matière et structure des solides (1h30) : résumé du chapitre sous forme d’un tableau en comparant les différentes liaisons physico-chimiques, les états de la matière et en donnant des exemples

Lectures recommandées : les cours, TD et TP des 3 UE du S1.

L’UE sera évaluée sous forme d’un contrôle continu. Une note d’implication et de progression sera aussi attribuée aux étudiants.

- Animer un atelier. - Gérer un groupe d'enfants. - Transmettre ses connaissances de manière claire et attractive. - Capter l'attention d'un auditoire. - Rédiger un rapport sur un des ateliers animés. - Développer son esprit critique.

La MISS (Maison d’Initiation et de Sensibilisation aux Sciences), le laboratoire universitaire des 8-15 ans, accueille tout au long de l’année, dans un bâtiment dédié de la Faculté des Sciences d’Orsay, des classes d’écoles élémentaires et de collèges pour des ateliers d’une journée construits autour de la démarche d’investigation scientifique, sur des sujets en lien avec les recherches des laboratoires environnants.

Depuis la rentrée 2018, la MISS met en place des ateliers au format plus court (environ 2h30) autour du thème de la chimie amusante.

Les élèves, encadrés par les étudiants de L1, mènent une enquête pour désigner un coupable grâce à des expériences ludiques de chimie (reconnaitre ce que le coupable a bu grâce au pH, avec quel stylo il a écrit grâce à la chromatographie, analyser la terre sous sa chaussure grâce à des réactions chimiques spécifiques ou révéler un message effacé écrit avec différents types de stylos).

Dans les années à venir, d'autres thèmes pourront être proposés permettant une diversification des ateliers.

Savoir évaluer si un comportement ou une parole répond à l'un des 20 critères de la discrimination reconnus par la loi. Comprendre quels sont les comportements qui sont à proscrire en matière de discrimination. Apprendre à interagir avec les autres de manière égale quels qu'ils soient.

Cette UE se déroule en deux temps :

• Dans un premier temps, les étudiants assistent à un cycle de conférences faites par des spécialistes travaillant dans le domaine de l'étude des comportements discriminatoires et/ou de la lutte contre la discrimination. Les thématiques abordées lors des conférences peuvent évoluer d'une année à l'autre. Celles qui sont actuellement présentées sont : Comment lutter contre les discriminations en économie ?; Le fait religieux dans l'État de droit ; Libertés fondamentales, laïcité, action publique ; Racisme, antisémitisme et discriminations ; Les discriminations économiques sur le terrain ; La discrimination via les réseaux sociaux ; Egalité Homme/Femme ; Egalité des personnes handicapées.
• Dans un deuxième temps, les étudiants doivent travailler sur un organisme ou une association œuvrant dans le domaine de la diversité et de la lutte contre les discriminations. L'objectif est d'analyser le domaine d'activité, le mode de fonctionnement, les actions et les interactions avec les bénéficiaires et les pouvoirs publics etc. Les étudiants peuvent partir du site internet, pour ensuite prendre contact avec les représentants de la structure (email, téléphone ou présentiel). Les étudiants, par groupes de 2 ou 3, font ensuite une présentation orale de l'association qu'ils auront choisie.

• Observer et reconnaître différents types de roches et minéraux
• Utiliser une boussole pour s’orienter et mesurer un pendage
• Décrire un affleurement
• Se localiser sur une carte
• Lire et comprendre les informations d’une carte géologique et d’un schéma structural
• Représenter et comprendre une coupe géologique
• Dessiner un schéma représentatif d’un affleurement avec le vocabulaire approprié
• Intégrer des informations acquises sur plusieurs jours et les restituer dans une histoire simple

Le but de cette UE est d’initier les étudiants aux méthodes de travail en géosciences sur le terrain. Les étudiants observeront et décriront des affleurements de roches de différentes origines (sédimentaires, magmatiques, métamorphiques) et les roches qu’ils contiennent. Ils appliqueront des outils et méthodes relevant du domaine des géosciences (voir détails ci-après). Les étudiants restitueront leur travail dans un carnet de terrain, pour, in fine, interpréter les faits observés à l’aide des concepts géologiques étudiés durant l’année. Les étudiants rédigeront les résultats de leur travail dans un rapport de terrain.

Semestres 1 et 2 UE fondamentales (Système Terre, Climats, Energies) et d’option (Mesures en géosciences, Roches et Minéraux)

• Boillot, G., Huchon, P. et Lagabrielle, Y., 2008. Introduction à la géologie. Dunod, Paris, 217 pp., ISBN: 978-2-10-051530-1
• Michel Hoffert, André Schaaf, Marc Tardy, Armelle Baldeyrou Bailly, Gilles Merzeraud, André Brahic, René Maury Sous la coordination de Jean-Yves Daniel 2014. Sciences de la Terre et de l'univers. Vuibert, 3e édition, 832 p., ISBN : 978-2-311-00967-5
• Peycru, P., 2008. Géologie, tout-en-un 1ère et 2ème année BCPST. Dunod, Paris, 641 pp. ISBN: 978_2_10-053790-7
• Renard, M., Lagabrielle, Y., Martin, E., de Rafélis, M., 2015. Eléments de géologie, 15ème édition du « Pomerol », Dunod, Paris, 1142 pp. ISBN: 978-2-10-072480-2
• Robert, C. et R. Bousquet, 2013. Géosciences, La dynamique du système Terre. Belin, Paris, 1160 pp., ISBN: 978-2-7011-3816-9
• Simien, F., 2009, La France sous nos pieds, Atlas en 50 Géocartes. BRGM, ISBN-13 : 978-2715924741.
• Sorel, D. et P. Vergely, 2018. Atlas d’intiation aux cartes et coupes géologiques, Dunod, 128 pp., EAN

Le stage de terrain se déroule sur cinq jours et sera validé par la rédaction d’un rapport final.

• Décrire, observer, manipuler différents types de roches (magmatiques, métamorphiques, sédimentaires, d’altération)
• Distinguer et cataloguer différents domaines géologiques à partir de documents cartographiques
• Acquérir les bases dans les domaines de la pétrographie et la minéralogie
• Choisir des outils mathématiques et géochimiques simples afin de retrouver les caractéristiques des roches
• Reproduire une expérimentation permettant de comprendre la dynamique de croissance ou de dissolution des cristaux
• Restituer la classification des grandes familles de roches en choisissant les arguments appropriés

Le but de cette UE est de faire découvrir aux étudiants les matériaux des enveloppes terrestres par la description et l’observation macroscopiques des différentes familles de roches. L’étudiant définira également les minéraux constitutifs de ces roches. In fine, l’étudiant pourra restituer les processus de formation et de cristallisation guidant leur formation. Pour atteindre cet objectif, les étudiants examineront des cartes géologiques pour associer des types de roches aux grands domaines de la géologie de la France. L’étudiant pourra alors discuter des conditions de leur formation et leur évolution au cours du temps. In fine, les étudiants devront associer la composition minéralogique des roches aux principes de géochimie et de cristallochimie permettant de comprendre leur formation.

UE fondamentales (Système Terre, Climats, Energies) et d’option (Mesures en géosciences)

Semestre 2

• Michel Hoffert, André Schaaf, Marc Tardy, Armelle Baldeyrou Bailly, Gilles Merzeraud, André Brahic, René Maury Sous la coordination de Jean-Yves Daniel 2014. Sciences de la Terre et de l'univers. Vuibert, 3e édition, 832 p., ISBN : 978-2-311-00967-5.
• Jean-François Beaux, Jean-François Fogelgesang, Philippe Agard, Valérie Boutin. 2015. Atlas de géologie-pétrologie BCPST 1re et 2e années. Dunod, 2ème édition, 144 p., EAN13 : 9782100726547.
• Yves Lagabrielle, René Maury, Maurice Renard. 2013. Mémo visuel de géologie - L'essentiel en fiches et en couleurs. Dunod, 256 p., EAN13 : 9782100584994.
• Simien, F., 2009, La France sous nos pieds, Atlas en 50 Géocartes. BRGM, ISBN-13 : 978-2715924741.
• Sorel, D. et P. Vergely, 2018. Atlas d’intiation aux cartes et coupes géologiques, Dunod, 128 pp., EAN9782100791439

Les enseignements seront dispensés sous forme de cours magistraux et de travaux pratiques et dirigés associés. L’évaluation sera faite via une épreuve finale de synthèse mais également par un suivi régulier (modalités de contrôle des connaissances à préciser).

A l’issue de cet enseignement, l’étudiant sera capable de :

1- Percevoir le fonctionnement mental lors de l’apprentissage et développer/perfectionner des méthodes permettant de réussir ses apprentissages

• définir la notion d’évocation et de palette évocative
• distinguer les différents types de mémoire (à court et long terme, visuelle/auditive /kinesthésique/sinesthésique) et se familiariser avec des techniques de mémorisation
• identifier son propre fonctionnement mental (type d’évocation, mémoires dominante/secondaires…), pour l’exploiter dans la prise de note et l’apprentissage d’un cours

2- Développer une méthodologie scientifique

• Représenter avec pertinence des données (quantitatives) expérimentales (tableaux, graphes…)
• Générer une figure multi-panneaux à partir de différents éléments et construire une légende détaillée
• Analyser (décrire et interpréter) des données scientifiques avec un esprit critique

3- Comprendre un message scientifique sous toutes ses formes

• Repérer la structure et les informations essentielles d’un texte, les hiérarchiser en identifiant les liens logiques, les relier
• Formuler la problématique d’un article scientifique en anglais et identifier les résultats principaux
• Comprendre une question d’examen

4- Communiquer de manière correcte dans un contexte scientifique

• Exprimer une idée : se faire comprendre, convaincre, à l’écrit (rédaction de compte-rendu, répondre à une question d’examen), à l’oral (présentation en équipe d’un article scientifique)
• Construire un diaporama ou un poster illustrant son discours oral pour présenter un article scientifique
• Travailler en équipe

L'objectif est d'aider les étudiants à devenir autonomes et efficaces à l'université et, plus tard, dans la vie professionnelle. Il s'agit d’acquérir de bonnes méthodes d’apprentissage, d'être capable d'analyser, de structurer et de hiérarchiser les données et les informations disponibles, mais aussi d'améliorer leurs capacités d'exploitation et de retransmission de ces données, que ce soit oralement ou par écrit. Cette UE est également l’occasion de découvrir différentes facettes du métier de chercheur.

Pas de pré-requis

Semestre 2

L’UE est organisée en 11 séances de TD de 2 h et 1 séance de TD de 3h (1 séance par semaine). L’ensemble de l’enseignement d’un groupe de TD sera assuré par un même enseignant. L’enseignement est interactif et nécessite donc une participation active des étudiant-e-s au cours des séances. Des activités collaboratives seront régulièrement proposées lors et entre les séances.

Semestre 2